建築中

木造住宅の建て方中に、雨に降られ、柱や梁などの材料が濡れてしまいましたが大丈夫でしょうか？

屋根がかかるまでは雨で濡らさないことが理想です。
雨が降ってきた場合、状況により養生シートを掛けるなど手当をしますが、柱や梁などの構造材は、雨に濡れても、自然乾燥してしまいますので特に問題は、無いと考えます。
ただし２×４工法の場合は、構造用合板で内部を覆ってしまい乾燥しにくいため、建て方は、雨が降りそうな日は避け、屋根や外壁側壁に防水紙を貼るまでは、降雨が予想される場合は、養生シートを掛けるなど対策をした方がよいでしょう。

注文住宅で家を建築中です。建て主として注意すべきことは、ありますか。

工事が始まったら業者にすべておまかせでなく、こまめに現場に行くことも必要です。
ただし現場は、危険な場所や養生箇所などがありますので現場責任者の方の案内に従ってください。
現場では、施工中の隠れてしまう部分の写真をたくさん撮っておいてください。
後で問題が発生した場合や増築など工事を新たにする場合などにも役に立ちます。また、業者との打ち合わせでは、内容は必ず議事録として残して双方でサインし、コピーをもらうとよいでしょう。